MySQL galt lange Zeit nur als Standard-Datenbank für Webanwendungen unter Linux / PHP. Aber auch auf Windows Systemen und anderen Programmiersprachen lässt sich die kostenlose Datenbank MySQL einsetzen. MySQL kann als lokale Desktop Datenbank aber auch als Datenbankserver fürs Netzwerk oder Internet genutzt werden. Die mittlerweile verfügbaren ODBC-Treiber ermöglichen den Zugriff von nahezu jeder Windows Anwendung aus.
Besonders geschätzt wird MySQL natürlich für Webanwendungen. Gegenüber ANSI SQL92 besitzt MySQL einige komfortable zusätzliche Funktionen wie bsw. die Suche über reguläre Ausdrücke. Pageing, Indizes und Suchfunktionen erleichtern den Umgang mit Daten. Nicht unterstütz werden bsw. die von Oracle oder SQL-Server bekannten weitergehenden Features wie Tigger, gespeicherte Prozeduren, Sichten oder Transaktionen.
Über das enthaltene Verwaltungsprogramm winMySQLAdmin bearbeiten sie die Konfiguration und Nutzerrechte des Datenbankservers. Der MySQLManager erlaubt das Anlegen und Bearbeiten von Datenbanken, Tablellen und Daten. Der MySQL-Monitor ermöglicht das Ausführen von SQL-Kommandos und die Anzeige der Abfrageergebnisse.